БЦ Фарватер находится в Адмиралтейском районе недалеко от Винокурцевского сквера. Рядом находится Витебский вокзал и станция метрополитена «Пушкинская», есть остановки наземного общественного транспорта. Расположение комплекса неподалеку от набережной Обводного канала, а также Невского, Московского и Загородного проспектов.